કર્ણાટક સરકારે સીબીઆઈની પરવાનગી વિના પ્રવેશ પર પ્રતિબંધ મૂક્યો છે. એટલે કે, જો સીબીઆઈ કોઈપણ કેસની તપાસ કરવા માંગે છે, તો તેણે રાજ્ય સરકારની પરવાનગી લેવી પડશે. આવું એટલા માટે કરવામાં આવ્યું છે કારણ કે દિલ્હી એક્ટને ધ્યાનમાં રાખીને CBIની રચના કરવામાં આવી છે.
કર્ણાટક સરકારના આ નિર્ણય બાદ સીબીઆઈ હવે સીધા કર્ણાટકમાં પ્રવેશ નહીં કરી શકે. જો કે, જો કોઈ વિશેષ કેસમાં હાઈકોર્ટની પરવાનગી મળે તો સીબીઆઈ તપાસ માટે કર્ણાટક જઈ શકે છે. બંગાળમાં ઘણા કિસ્સામાં આવું બન્યું છે.
કોલકાતા હાઈકોર્ટની સૂચના પર, સીબીઆઈ સંદેશખાલી અને આરજી કાર મેડિકલ રેપ કેસની તપાસ કરવા બંગાળમાં પ્રવેશી. એકંદરે જો આ મામલો હાઈકોર્ટમાં જાય અને હાઈકોર્ટ કહે કે સીબીઆઈ તપાસ થવી જોઈએ તો સીબીઆઈ કર્ણાટકમાં તપાસ કરી શકે છે.